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  • 論文紹介【第10回論文紹介】

論文紹介

 ここでは、本研究グループで最近発表された論文の一部を簡単に紹介しています。もっと詳しく研究内容を知りたい方は、研究室のHPもご参照下さい。

【第10回論文紹介(2012.12)】

研究代表者

松永 幸大
馳澤 盛一郎

所 属

東京理科大学理工学部
東京大学大学院新領域創成科学研究科

著 者

Kutsuna, N.*, Higaki, T.*, Matsunaga, S.*, Otsuki, T., Yamaguchi,M., Fujii, H. and Hasezawa, S. *These authors equally contributed to this work.
(朽名 夏麿、桧垣 匠、松永 幸大、大槻 知史, 山口 雅之, 藤井 博史 & 馳澤 盛一郎)

論文題目 Active learning framework with iterative clustering for bioimage classification.
(バイオ画像の分類のための反復的クラスタリングを用いた能動学習フレームワーク)
発表誌

Nat. Commun., 3, 1032.(2012)

研究代表者

杉山 宗隆

所 属

東京大学大学院理学系研究科附属植物園

著 者

Otsuka, K., Sugiyama, M.
(大塚 蔵嵩、杉山 宗隆)

論文題目

Tissue organization of fasciated lateral roots of Arabidopsis mutants suggestive of the robust nature of outer layer patterning.
(シロイヌナズナ突然変異体の帯化側根が示す外側のパターン形成の頑健性を反映した組織構成)

発表誌

Journal of Plant Research 125, 547-554 (2012)

研究代表者

杉山 宗隆

所 属

東京大学大学院理学系研究科附属植物園

著 者

Nozaki, M., Sugiyama, M., Duan, J., Uematsu, H., Genda, T., Sato, Y.
(野崎 守、杉山 宗隆、段 俊、植松 広、源田 竜也、佐藤 康)

論文題目

A missense mutation in the glucosamine-6-phosphate N-acetyltransferase-encoding gene causes temperature-dependent growth defects and ectopic lignin deposition in Arabidopsis.
(グルコサミン-6-リン酸N-アセチルトランスフェラーゼをコードする遺伝子のミスセンス変異はシロイヌナズナに温度依存的な成長不全と異所的リグニン蓄積を引き起こす)

発表誌

The Plant Cell 24, 3366-3379 (2012)

研究代表者

杉山 宗隆

所 属

東京大学大学院理学系研究科附属植物園

著 者

Iwamoto, A., Kondo, E., Fujihashi, H., Sugiyama, M.
(岩元 明敏、近藤 衣里、藤橋 弘朋、杉山 宗隆)

論文題目

Kinematic study of root elongation in Arabidopsis thaliana with a novel image-analysis program.
(新規画像解析プログラムを用いたシロイヌナズナの根端成長の細胞動力学的研究)

発表誌

Journal of Plant Research 印刷中

研究代表者

寿崎 拓哉

所 属

基礎生物学研究所 共生システム研究部門

著 者

Takuya Suzaki, Koji Yano, Momoyo Ito, Yosuke Umehara, Norio Suganuma and Masayoshi Kawaguchi
(寿崎 拓哉、矢野 幸司、伊藤 百代、梅原 洋佐、菅沼 教生、川口 正代司)

論文題目

Positive and negative regulation of cortical cell division during root nodule development in Lotus japonicus is accompanied by auxin response.
(ミヤコグサの根粒形成におけるオーキシン応答を伴う皮層細胞分裂の正および負の制御機構)

発表誌

Development 139, 3997-4006 (2012)

研究代表者

関 原明

所 属

理化学研究所 植物科学研究センター 
植物ゲノム発現研究チーム

著 者

Jong-Myong Kim, Taiko Kim To, Maho Tanaka, Takaho A. Endo, Akihiro Matsui, Junko Ishida, Fiona C. Robertson,
Tetsuro Toyoda and Motoaki Seki
(金 鍾明、藤 泰子、田中 真帆、遠藤 高帆、松井 章浩、石田 順子、Fiona C. Robertson、豊田 哲郎、関 原明)

論文題目

Highly-reproducible ChIP-on-chip analysis to identify genome-wide protein binding and chromatin status in
Arabidopsis thaliana.
(シロイヌナズナに特化した再現性の高いChIP-on-chip技術を用いたクロマチン状態のゲノムワイドな解析法)

発表誌

"In Methods in Molecular Biology; The Arabidopsis Protocols, 3rd edition. (Edited by Julio Salinas and
Jose J. Sanchez-Serrano)". Humana Press. (2012) (in press).

研究代表者

中島 敬二

所 属

奈良先端科学技術大学院大学・バイオサイエンス研究科

著 者

Takamitsu Waki, Shunsuke Miyashima, Miyako Nakanishi, Yoichi Ikeda, Takashi Hashimoto and Keiji Nakajima
(和氣 貴光、宮島 俊介、中西 美耶子、池田 洋一、橋本 隆、中島 敬二)

論文題目

A GAL4-based targeted activation tagging system in Arabidopsis thaliana
(GAL4を用いたシロイヌナズナの標的型アクティベーションタギングシステム)

発表誌

"Plant J. 2012, in press Advance online publication DOI: 10.1111/tpj.12049

研究代表者

塚谷 裕一

所 属

東京大学大学院理学系研究科

著 者

Ali Ferjani, Shoji Segami, Gorou Horiguchi, Azusa Sakata, Masayoshi Maeshima, and Hirokazu Tsukaya
(フェルジャニ アリ、瀬上 紹嗣、堀口 吾朗、坂田 あずさ、前島 正義、塚谷 裕一)

論文題目

Regulation of pyrophosphate levels by H+-PPase is central for proper resumption of early plant development
(液胞型H+-PPaseによるピロリン酸の量の調節は植物の初期発生に重要である)

発表誌

Plant Signaling & Behavior 7, 38-42 (2012)

研究代表者

塚谷 裕一

所 属

東京大学大学院理学系研究科

著 者

Hokuto Nakayama, Takahiro Yamaguchi, and Hirokazu Tsukaya
(中山 北斗、山口 貴大、塚谷 裕一)

論文題目

Cladodes, leaf-like organs in Asparagus, show the significance of co-option of pre-existing genetic regulatory circuit for morphological diversity of plants
(アスパラガス属の葉状器官である仮葉枝は植物の形体的多様性における既存の遺伝子ネットワークの転用の重要性を示す)

発表誌

Plant Signaling & Behavior 7: 961-964 (2012)

研究代表者

高橋 卓

所 属

岡山大学大学院自然科学研究科

著 者

yaka Takano, Jun-ichi Kakehi, Taku Takahashi
(高野 綾香,懸樋 潤一,高橋 卓)

論文題目

Thermospermine is not a minor polyamine in the plant kingdom.
(サーモスペルミンは植物界において希少なポリアミンではない.)

発表誌

Plant Cell Physiol. 53: 606-616 (2012)

研究代表者

矢崎 一史

所 属

京都大学 生存圏研究所

著 者

Yoshihisa Kamimoto, Kazuyoshi Terasaka, Masafumi Hamamoto, Kojiro Takanashi, Shoju Fukuda, Nobukazu Shitan, Akifumi Sugiyama, Hideyuki Suzuki, Daisuke Shibata, Bangjun Wang, Stephan Pollmann, Markus Geisler, and Kazufumi Yazaki
(紙本 宜久、寺坂 和祥、濱本 正文、高梨 功次郎、福田 正充、士反 伸和、杉山 暁史、鈴木 秀幸、柴田 大輔、Bangjun Wang、Stephan Pollmann、Markus Geisler、矢崎 一史)

論文題目

Arabidopsis ABCB21 is a facultative auxin importer/exporter regulated by cytoplasmic auxin concentration
(ミシロイヌナズナのABC21は細胞質オーキシン濃度に制御される通性のオーキシン取込み/排出輸送体である)

発表誌

Plant Cell Physiology (in press)

研究代表者

福田裕穂

所 属

東京大学 大学院理学系研究科

著 者

Yoshihisa Oda, Hiroo Fukuda
(小田祥久、福田裕穂)

論文題目

Initiation of Cell Wall Pattern by a Rho- and Microtubule-Driven Symmetry Breaking
(Rhoと微小管がひき起こす対称性の破れによる細胞壁パターンの形成)

発表誌

Science 337,1333-1336, 2012

研究代表者

町田泰則

所 属

名古屋大学大学院理学研究科

著 者

Nakagawa A, Takahashi H, Kojima S, Sato N, Ohga K, Cha BY, Woo JT, Nagai K, Horiguchi G, Tsukaya H, Machida Y, Machida C.

論文題目

Berberine enhances defects in the establishment of leaf polarity in asymmetric leaves1 and asymmetric leaves2 of Arabidopsis thaliana.
(ベルベリンはシロイヌナズナのasymmetric leaves1, asymmetric leaves2変異体における葉の向背軸性の異常を亢進する)

発表誌

Plant Mol. Biol. 79: 569-581 (2012)

研究代表者

町田泰則

所 属

名古屋大学大学院理学研究科

著 者

Hiro Takahashi, Ayami Nakagawa, Shoko Kojima, Anna Takahashi, Byung-Yoon Cha, Je-Tae Woo, Kazuo Nagai, Yasunori Machida, Chiyoko Machida
(高橋広夫・中川彩美・小島晶子・高橋アンナ・車炳允・禹済泰・永井和夫・町田泰則・町田千代子)

論文題目

Discovery of novel rules for G-quadruplex-forming sequences in plants by using bioinformatics methods
(バイオインフォマティクス手法を用いた植物ゲノムにおけるG-quadruplex構造を形成しうる配列に関する新ルールの発見 )

発表誌

J. Biosci. Bioeng. 114(5), 570-575 (2012)

研究代表者

町田泰則

所 属

名古屋大学大学院理学研究科

著 者

Pankaj Dhonukshe, Daan Weits, Alfredo Cruz-Ramirez, Simon Tindemans, Eva Deinum, Kalika Prasad, Klementina Kakar, Ari Pekka Mähönen, Chris Ambrose, Michiko Sasabe, Guy Wachsmann, Marijn Luijten, Tom Bennett, Yasunori Machida, Renze Heidstra, Geoff Wasteneys, Bela Mulder and Ben Scheres
(パンカジ・ドヌシュ, ダーン・ウェイツ,アルフレド・クルス-ラミレス, シモン・ティンデマン, エバ・デイヌム, カリカ・プラサド, クレメンティナ・カカル, アリ・ペッカ・メヘネン, クリス・アムブロス, 笹部美知子, ガイ・ワックスマン, マリン・リュッテン, トム・ベネット, 町田泰則, レンズ・ヘイドシュトラ, ゲフ・ ワステニース, ベラ・ムルデール, ベン・シュヘーレス)

論文題目

Transcription factor triggered auxin signaling dependent module  switches microtubule array orientation and cell division plane during formative cell divisions
(転写因子に誘起されるオーキシンシグナル依存的制御モヂュールは、造形的細胞分裂において、微小管の配向と細胞分裂面の切換えをしている)

発表誌

Cell 79: 569-581 (2012)

研究代表者

町田泰則

所 属

名古屋大学大学院理学研究科

著 者

Sumie Keta, Hidekazu Iwakawa, Masaya Ikezaki, Endang Semiarti, Shoko Kojima, Yasunori Machida , Chiyoko Machida
(氣多澄江、岩川秀和、池崎仁弥、セミアルティ・エンダン、小島昌子、町田泰則、町田千代子 )

論文題目

Roles of the ASYMMETRIC LEAVES2 gene in floral organ development in Arabidopsis thaliana
(シロイヌナズナの花器官分化における ASYMMETRIC LEAVES2 遺伝子の役割)

発表誌

Plant Biotechnology 29: 1-8 (2012)

研究代表者

伊藤正樹

所 属

名古屋大学大学院生命農学研究科

著 者

Nozomi Haga, Kosuke Kobayashi, Takamasa Suzuki, Kenichiro Maeo, Minoru Kub, Misato Ohtani, Nobutaka, Mitsuda, Taku Demura, Kenzo Nakamura, Gerd Jürgens, and Masaki Ito
(羽賀望、小林耕介、鈴木孝征、前尾健一郎、久保稔、大谷美沙都、光田展隆、出村拓、中村研三、Gerd Jürgens、伊藤正樹 )

論文題目

Mutations in MYB3R1 and MYB3R4 cause pleiotropic developmental defects and preferential down-regulation of multiple G2/M-specific genes in Arabidopsis thaliana
MYB3R1およびMYB3R4遺伝子の変異は、シロイヌナズナおいて多面的な発生異常とG2/M期特異的遺伝子群の発現の低下を引き起こす)

発表誌

Plant Physiol. 157: 706-717, 2011

研究代表者

伊藤正樹

所 属

名古屋大学大学院生命農学研究科

著 者

Eriko Iwata, Saki Ikeda, Natsumi Abe, Asuka Kobayashi, Mariko Kurata, Sachihiro Matsunaga, Yasushi Yoshioka, Marie-Claire Criqui, Pascal Genschik, Masaki Ito
(岩田恵里子、池田早希、阿部奈都美、小林明日香、倉田真理子、松永幸大、吉岡泰、Marie-Claire Criqui、Pascal Genschik、伊藤正樹)

論文題目

Roles of GIG1 and UVI4 in genome duplication in Arabidopsis thaliana.
(シロイヌナズナのゲノム倍加におけるGIG1とUVI4の役割)

発表誌

Plant Signal. Behav. 7: 1079-1081, 2012

研究代表者

伊藤正樹

所 属

名古屋大学大学院生命農学研究科

著 者

Satoshi Araki, Yasunori Machida, Masaki Ito
(荒木智史、町田泰則、伊藤正樹)

論文題目

Virus-induced gene silencing of NtmybA1 and NtmybA2 causes incomplete cytokinesis and reduced shoot elongation in Nicotiana benthamiana.
Nicotiana benthamiana におけるNtmybA1NtmybA2のウィルス誘導性ジーンサイレンシグは、不完全な細胞質分裂とシュートの伸長抑制を引き起こす)

発表誌

Plant Biotech. in press, 2012

研究代表者

伊藤正樹

所 属

名古屋大学大学院生命農学研究科

著 者

Eriko Iwata, Saki Ikeda, Sachihiro Matsunaga, Mariko Kurata, Yasushi Yoshioka, Marie-Claire Criqui, Pascal Genschik, and Masaki Ito
(岩田恵里子、池田早紀、松永幸大、倉田真理子、吉岡泰、Marie-Claire Criqui、Pascal Genschik、伊藤正樹)

論文題目

GIGAS CELL1, a novel negative regulator of the anaphase-promoting complex/cyclosome, is required for proper mitotic progression and cell fate determination in Arabidopsis.
(後期促進複合体を負に制御する新奇タンパク質GIGAS CELL1は有糸分裂の進行と細胞運命決定に必要である。)

発表誌

Plant Cell 23: 4382-4393, 2011